Mint minden botanikus kertnek, a nyíregyházinak is elsődleges feladata az oktatás az óvodás szinttől a tudományos szintig. A hét minden napján fogad a kert csoportokat. Szakképzett vezetők kísérik végig a vendégeket, és tartanak tájékoztatókat, előadásokat. A Főiskola intézményeként egyik legfontosabb funkciója a kertnek, hogy mint „élő laboratórium” szolgáljon. A biológia szakos diákok számára megtalálható itt az összes tananyagban szereplő növény, bemutatóórákra innen viszik a növényi részeket, vagy a gyerekeket hozzák le kerti sétára.
Nemcsak a főiskolával, hanem a középiskolákkal is szoros együttműködés jellemzi a kertet. A város szakiskoláinak rendszeres heti gyakorlóteret biztosít. Vendégei a kertnek a Lippai János Mezőgazdasági Szakközép- és Szakiskola diákjai is, akik cserébe gyakorlati munkájukkal segítik a kertet.